رهبر معظم انقلاب اسلامی گفتند: مرحوم علامه جعفری نسبت به مسائل دینی متعصب بود و به‌شدت نسبت به انحرافاتی که بروز می‌کرد، حساس بود و برخورد صریح می‌کرد.